巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium)AS1.127的淀粉酶基因的全碱基序列已被测定。结构基因由1982bp的单一开读框架组成。由DNA序列推测出的前体酶蛋白由659个氨基酸组成，N-端33个氨基酸为信号肽。成熟酶分子由626个氨基酸组成，分子量为68.676kD。该淀粉酶属糖化型α-淀粉酶。并与枯草杆菌(B.subtilis)168产生的糖化型α-淀粉酶之间有83.3%的同源性。分析发现两种菌产生的酶分子的N-端3/4的同源性为90.4%，而C-端1/4的同源性只有70%。序列排比结果说明在淀粉酶基因的趋异进化过程中，基因突变和遗传重组都曾起过作用。