真菌群体基因组学研究进展
Progress in fungal population genomics
  
DOI:  10.13344/j.microbiol.china.180888
中文关键词:重测序,群体遗传学,基因组,进化,适应
英文关键词:Re-sequencing, Population genetics, Genome, Evolution, Adaption
基金项目:湖北省技术创新专项重大项目(2018ABA095);中央高校基本科研业务费专项基金(2662018PY097)
作者单位E-mail
张荆城 华中农业大学应用真菌研究所 湖北 武汉 430070  
边银丙 华中农业大学应用真菌研究所 湖北 武汉 430070  
肖扬 华中农业大学应用真菌研究所 湖北 武汉 430070 xiaoyang@mail.hzau.edu.cn 
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中文摘要:
      近年来,随着第二代高通量测序技术的出现和发展,测序成本不断降低,完成全基因组测序的真菌物种迅速增加。以大规模测序为基础的群体基因组学,也逐渐应用于解析真菌的群体结构、物种形成、种群分化和位点特异性效应。本文综述了群体基因组学在工业真菌、病原真菌、食用真菌、共生真菌及其在表型性状遗传基础解析中的研究进展,并对其今后的发展方向进行了展望。
英文摘要:
      In recent years, with the emergence and development of the high-throughput next generation sequencing technology, the cost of sequencing decreases continuously and the number of fungal species with complete genome sequence increases rapidly. Population genomics based on large-scale sequencing has also been gradually used in dissecting population structure, speciation, population divergence and locus-specific effects in fungi. In this review, we summarize the progress of population genomics in industrial fungi, pathogenic fungi, edible fungi, symbiotic fungi and genetic architecture dissection of phenotypic traits, and discuss future development.
张荆城,边银丙,肖扬.真菌群体基因组学研究进展[J].微生物学通报,2019,46(2):345~353
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