微生物是地球上生命的主体之一，拥有丰富多彩的代谢途径，在一定程度上塑造了今天的地球。由于绝大部分环境中的微生物无法被分离和培养，微生物被喻为生命物质中的“暗物质”。近年来，迅猛发展的测序技术有力地推动了微生物“暗物质”的研究。依托2019年10月在湖南省长沙市举行的中国生态学学会微生物生态专业委员会学术年会，《微生物学通报》组织了“微生物生态学主题刊”，展现了我国微生物生态学研究的部分最新进展和成果，揭示了微生物的群落组成、功能的新视角和新技术方法。