COI基因作为丛赤壳科真菌DNA条形码的测试
Can COI gene be used as DNA barcode for the nectriaceous fungi?
  
中文关键词:种内与种间差异,PCR扩增与测序成功率,邻接树
英文关键词:intra-and inter-specific variation, PCR and sequencing success rate, neighbor-joining tree
基金项目:国家自然科学基金(No. 31070015);中国科学院知识创新工程项目(No. KSCX2-EW-J-6)
作者单位
赵鹏 中国科学院微生物研究所 真菌学国家重点实验室 北京100101 鲁东大学菌物科学与技术研究院山东省食用菌技术重点实验室 山东 烟台 264025 
罗晶 中国科学院微生物研究所 真菌学国家重点实验室 北京100101 
庄文颖 中国科学院微生物研究所 真菌学国家重点实验室 北京100101 
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中文摘要:
      以丛赤壳科33种76个菌株为材料,探讨COI基因作为该科DNA条形码的可能性。结果表明,该DNA片段存在较多内含子,为了获取某些种的短片段,需设计许多引物,PCR扩增与测序成功率低,难以达到便捷、快速的物种鉴定的目的。因此,COI不宜作为丛赤壳科的DNA条形码。对已获得的少数片段进行分析表明,该基因对丛赤壳科部分种具有较强的物种鉴别力。
英文摘要:
      COI gene was tested with 76 strains of 33 species of the nectriaceous fungi to investigate its feasibility of serving as a DNA barcode. The results indicated that introns are present in some species, which made it difficult for PCR amplification and sequencing. COI gene is not a good DNA barcode for this group. Analysis of the obtained COI sequences showed that this gene may have the capacity to distinguish species of the nectriaceous fungi.
赵鹏,罗晶,庄文颖. COI基因作为丛赤壳科真菌DNA条形码的测试[J]. 菌物学报, 2012, 31(2): 243-250
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