基于β-微管蛋白基因部分序列探讨灵芝属菌株的亲缘关系
  
中文关键词:序列分析  neighbour-joiningmethods  聚类分析  遗传多样性
英文关键词:
基金项目:
苏春丽1  2 唐传红2 张劲松2* 潘迎捷3*
1.南京农业大学生命科学学院微生物系 2.上海农业科学院食用菌研究所 3.上海水产大学 食品科学学院
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中文摘要:
      PCR分别扩增了38个灵芝属菌株的β-微管蛋白基因片段,并对PCR产物进行序列测定,得到419bp的一段核苷酸系列。根据MEGA2.1软件中的neighbour-joiningmethods对上述序列进行聚类分析,结果所有供试菌株被分成9个聚类组。中国栽培灵芝菌株分布于6个聚类组,其中树舌亚属、紫芝组的菌株各自聚成一组,灵芝组的菌株分成四组,但大部分灵芝组菌株均聚于同一组,这表明树舌亚属、紫芝组和灵芝组间的遗传差异较大,灵芝组内虽然存在着一定的遗传差异,但总体上亲缘关系比较近,遗传多样性并不丰富。同时,序列分析的结果显示,β-tubulin基因序列在第三位密码子和内含子部位有高的碱基替换率,这些变异提供了丰富的系统发育信息,提示β-tubulin基因适合于灵芝属菌株的亲缘关系研究。
英文摘要:
      
苏春丽 唐传红 张劲松 潘迎捷. 基于β-微管蛋白基因部分序列探讨灵芝属菌株的亲缘关系[J]. 菌物学报, 2006, 25(3):
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