白菜种传黑斑病菌rDNA ITS区序列分析
  
中文关键词:聚类分析  分类鉴定  A.brassicae  A.brassicicola  A.japonica
英文关键词:
基金项目:
肖长坤1 郑建秋1 李健强2* 师迎春1 Hasan Bolkan2  3
1.北京市植物保护站 2.中国农业大学农学与生物技术学院植物病理系 3.Campbell Researchand Development Campbell Soup Company; Davis
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中文摘要:
      本文以来自国内外的20株白菜黑斑病菌及近源种为研究材料,进行了5.8SrDNA及其侧翼ITS区的克隆、测序、序列变异及遗传进化关系分析。黑斑病菌及其近源种真菌核糖体5.8SrDNA及其侧翼ITS区序列比对结果显示,不同种菌株ITS1比ITS2在碱基构成上有更大变异,而且ITS1的序列长度变异比ITS2的大;而种内虽然各菌株的寄主和地理来源不同,但ITS1和ITS2在长度上均没有变异,碱基构成上存在微小的变异。对该区序列的聚类分析表明,白菜黑斑病菌3个种芸薹链格孢Alternariabrassicae、甘蓝链格孢A.brassicicola和萝卜链格孢A.japonica虽然地理来源和寄主不同,但种内的不同菌株均在一个独立的聚类组中,种之间以及其和链格孢属内其它种在聚类关系上能明显分开,可基于该区进行黑斑病菌的分类鉴定。
英文摘要:
      
肖长坤 郑建秋 李健强 师迎春 Hasan Bolkan. 白菜种传黑斑病菌rDNA ITS区序列分析[J]. 菌物学报, 2005, 24(3):
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