微生物学通报  2016, Vol. 43 Issue (3): 541-549

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李小林, 李强, 金鑫, 陈诚, 熊川, 戢林, 李廷轩, 郑林用
LI Xiao-Lin, LI Qiang, JIN Xin, CHEN Cheng, XIONG Chuan, JI Lin, LI Ting-Xuan, ZHENG Lin-Yong
采收期松茸菌塘土壤理化特性及对细菌多样性的影响
Effect of soil physical and chemical properties on bacterial diversity in Tricholoma matsutake shiroes at harvest
微生物学通报, 2016, 43(3): 541-549
Microbiology China, 2016, 43(3): 541-549
10.13344/j.microbiol.china.150419

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收稿日期: 2015-05-26
接受日期: 2015-07-01
优先数字出版日期(www.cnki.net): 2015-12-04
采收期松茸菌塘土壤理化特性及对细菌多样性的影响
李小林1, 李强1, 2, 金鑫1, 陈诚1, 3, 熊川1, 2, 戢林3, 李廷轩3, 郑林用1, 2     
1. 四川省农业科学院土壤肥料研究所 四川 成都 610066;
2. 四川大学生命科学学院 四川 成都 610065;
3. 四川农业大学资源学院 四川 成都 611130
摘要: 【目的】探讨四川松茸菌塘土壤理化因素对细菌多样性的影响。【方法】应用DGGE (denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)技术分析和比较四川省小金、雅江、木里、盐源及盐边县松茸主产区的松茸菌塘土壤与对照土壤在松茸采收期的细菌多样性,并结合不同样品土壤理化因子的差异,采用主成分分析(PCA)和多元回归树分析(MRT)方法研究土壤理化因子对细菌多样性的影响。【结果】不同样品土壤理化性质之间差异明显,菌塘土壤的总体肥力水平明显高于非菌塘土壤;不同县域之间土壤微生物多样性指数有着明显差异,且同一地区内的对照土壤微生物多样性指数与菌塘土壤之间并没有相关性;MRT结果表明,当有效铜含量为0.296 7 mg/kg≤Cu<0.651 7 mg/kg时,有机质在此限量内(136.5 g/kg≤OM≤257.1 g/kg)含量越大、速效氮在该范围内(151.2 mg/kg≤AN≤277.0 mg/kg)含量越高,松茸菌塘土壤细菌多样性越大;而当Cu≥0.651 7 mg/kg时,pH在该范围内(4.800<pH<6.028)越小、有效铜在此限量内(0.651 7 mg/kg≤Cu<2.040 0 mg/kg)含量越小、交换性钙在该限量内(9.697 cmol/kg≤Ca<23.300 cmol/kg)含量越大、速效钾在该限量内(243.0 mg/kg≤AK<296.7 mg/kg)含量越大,松茸菌塘土壤细菌多样性越大。【结论】有效铜、有机质、pH、速效氮、交换性钙及速效钾6个因子对菌塘土壤细菌多样性影响最大。
关键词: 土壤理化因素    松茸    细菌    多样性    多元回归树    
Effect of soil physical and chemical properties on bacterial diversity in Tricholoma matsutake shiroes at harvest
LI Xiao-Lin1, LI Qiang1,2 , JIN Xin1, CHEN Cheng1,3 , XIONG Chuan1,2, I Lin3, LI Ting-Xuan3, ZHENG Lin-Yong1,2     
1. Soil and Fertilizer Research Institute,Sichuan Academy of Agricultural Sciences,Chengdu,Sichuan 610066,China;
2. School of Life Sciences,Sichuan University,Chengdu,Sichuan 610065,China;
3. College of Resources,Sichuan Agricultural University,Chengdu,Sichuan 611130,China
Received: May 26, 2015; Accepted: July 01, 2015; Published online (www.cnki.net): December 04, 2015
Foundation item: Key Technology R&D Program of Sichuan (No. 2013NZ0029, 2014FZ0004); Youth Foundation Program of the Financial & Innovational Capacity Building Project of Sichuan (No. 2014CXSF-030)
Corresponding author: ZHENG Lin-Yong: Tel/Fax: 86-28-84504965; E-mail: zly6559@126.com
Abstract: [Objective] To investigate the effect of physical and chemical properties on the diversity of bacteria of Tricholoma matsutake shiroes. [Methods] Soil from Tricholoma matsutake shiroes and control treatments were collected at the T. matsutake’s harvest time in the main producing areas Xiaojin,Yajiang,Muli,Yanyuan,and Yanbian in Sichuan denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) was used to analyze the bacterial diversity in shiroes. Physical and chemical properties of soil samples were analyzed. Data analysis was done using principal component analysis (PCA) and multiple regression tree analysis (MRT). [Results] The physical and chemical properties of shiro soils were significantly different. The fertility level was significantly higher in shiro soils than in control treatments. The diversity indices in different counties were significantly different. However,bacterial diversity in the control soils was not necessarily lower than in shiro soils from the same area. MRT showed that higher organic matter (OM,136.5 g/kg≤OM≤257.1 g/kg) and higher available nitrogen (AN,151.2 mg/kg≤AN≤277.0 mg/kg) increased the bacterial diversity of shiro soils when the concentration of available copper (Cu) was higher than or equal to 0.296 7 mg/kg and less than 0.651 7 mg/kg. Whereas,lower pH (4.800<pH<6.028),lower available copper (0.651 7 mg/kg≤Cu<2.040 0 mg/kg),higher exchangeable calcium (Ca,9.697 cmol/kg≤Ca≤23.300 cmol/kg) and higher available potassium (243.0 mg/kg≤AK<296.7 mg/kg) increased the bacterial diversity of shiro soils when the concentration of available copper higher or equal 0.651 7 mg/kg. [Conclusion] Available copper,organic matter,pH,available nitrogen,exchangeable calcium and available potassium were the major physical and chemical properties affecting the bacterial diversity of T. matsutake shiroes.
Key words: Physical and chemical properties    Tricholoma matsutake    Bacteria    Diversity    Multiple regression tree    

松茸Tricholoma matsutake (Ito et Imai) Singer是一种名贵的外生菌根真菌,至今还无法进行人工栽培[1]。究其原因,一方面是松茸整个生长过程较为缓慢,一般为5−6年甚至10年以上;另一方面是松茸对其生长环境要求极为苛刻[2]。菌塘是松茸和寄主植物共同组成的土壤环境系统,是松茸生长发育的重要场所,对松茸的生长和发育起着至关重要的作用[3]。而菌塘微生物的活动作为物质循环和能量转换的重要参与者,在该系统中起着特别重要的作用。因为微生物可以通过其活动来改变菌塘的养分循环、矿物分解及团粒结构等,进而影响松茸的生长。因此,研究松茸菌塘微生物的群落结构对于松茸的人工抚育甚至是人工栽培均有重要作用。

对于松茸菌塘微生物的了解,前人研究取得了一定的进展。杨民和等[4]通过可培养方法对松茸菌塘土壤研究发现,深紫被孢霉(Mortierella vinacea)是绝对的优势菌,而其它土壤微生物数量则相对较少。刘培贵等[5]研究发现,松茸菌塘的细菌和放线菌的“消失”与松茸地下菌丝的活动有着密切的联系。也有研究认为,存在于松茸菌塘内的地下菌丝和菌根每年向外进行扩展的过程中能释放某些物质进而抑制该区域内的细菌和放线菌的生长,以降低寄主根部受病原菌的侵染[6]。而姜华等[7]则认为松茸菌塘土壤可培养细菌的多样性较为丰富。但这些研究更多的是以可培养的传统方式来进行,由于自然界中绝大多数微生物无法进行纯培养[8],因此以分子为基础的免培养能很好地补充菌塘微生物的群落结构信息。张俊[9]通过DGGE技术研究了四川雅江松茸生长地的微生物,很好地了解了当地微生物的多样性和群落结构,但由于样品仅局限于松茸林地,因而仍然无法很好地获得松茸菌塘的微生物信息。目前为止,对松茸菌塘微生物的研究仍然甚少,尤其是结合环境生态因子探讨其对松茸菌塘细菌多样性的影响尚未见报道。

本文以四川5个松茸主产区的25个松茸菌塘及5个非菌塘土壤为研究对象,采用DGGE方法研究了菌塘细菌多样性,并测定了土壤理化性质,同时分析了土壤理化因子对细菌多样性和群落结构的影响,以期为松茸的人工抚育甚至是人工栽培提供基础理论依据。

1 材料与方法 1.1 样品采集

于2013年8月,分别在具有代表性的小金(XJ)、雅江(YJ)、木里(ML)、盐源(YY)及盐边(YB)各县随机选择5个松茸菌塘样方,并在大致相同的地形因子条件下,每个大的主产区选取1个不产松茸的空白对照土壤样方,土壤采集均设置3次重复,重复均按照“三角形法”进行布设[10]。去掉枯枝落叶等杂物后取0−10 cm深度的土壤,将样品装入无菌袋,带回实验室低温保存,去除样品中石块、动植物残体后将样品过2 mm尼龙网筛,装入无菌塑料袋,其中一份置于−20 °C保存用于提取总DNA,而另一份经自然风干后研磨过筛,用于土壤理化性质的测定。

1.2 土壤理化分析

菌塘土壤pH采用pH计测定(土水比1:2.5),有机质采用重铬酸钾外加热容量法,全氮采用凯氏蒸馏法,速效氮采用碱解扩散法,速效磷采用碳酸氢钠浸提-钼锑抗比色法,速效钾采用乙酸铵提取-火焰光度法,有效铁、有效锰和有效铜采用二乙三胺五乙酸(Diethylene triamine pentacetate acid,DTPA)浸提-原子吸收分光光度法测定,交换性钙及交换性镁均采用乙酸铵交换-原子吸收分光光度计法[11]

1.3 土壤样品总DNA提取

所有土壤样品总DNA的提取用Fast DNA SPN Kit for Soil (Bio-Rad Co.,美国)试剂盒参照说明书进行,纯化用UNIQ-10 DNA纯化试剂盒(上海生工,中国)进行,然后于−20 °C保存备用。

1.4 DGGE分析 1.4.1 PCR扩增:细菌16S rRNA基因的扩增采用引物F338GC (5′-ACTCCTACGGGAGGCAGCAG-3′)和R518 (5′-ATTACCGCGGCTGCTGG-3′),其中F338GC前端经GC夹板修饰(5′-CGCCCGCCGCGCGCGGCGGGCGGGGCGGGGGCACGGGGGG-3′)[12]。反应体系(50 μL):2×PCR mix (0.1 U/μL Taq酶,500 μmol/L dNTP each,20 mmol/L Tris-HCl pH 8.3,100 mmol/L KCl和3 mmol/L MgCl2) 25 μL;正反向引物(25 pmol/L)各0.5 μL;模板DNA (30−50 μg/L) 2.0 μL;无菌ddH2O补足至50 μL。扩增程序采用Touch-down PCR程序:94 °C 5 min;94 °C 1 min,65−55 °C 50 s (每个循环温度降低0.5 °C),72 °C 1.5 min,20个循环;94 °C 1 min,55 °C 50 s,72 °C 1.5 min,15个循环;72 °C 7 min;12 °C恒温保存。PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳检测,并用UNIQ-10 DNA纯化试剂盒(上海生工,中国)进行纯化,−20 °C保存备用。

1.4.2 变性梯度凝胶电泳(DGGE):取扩增纯化后的PCR产物15−20 μL,加2−5 μL溴酚蓝进行DGGE分析。细菌采用变性梯度为25%−55%的10%的聚丙烯酰胺凝胶(100%的变性剂为尿素7 mol/L和40%的去离子甲酰胺)。使用1×TAE缓冲液,50 V 50 min进胶,再在160 V、60 °C电泳5 h。电泳后采用改进的硝酸银染色法对凝胶进行染色[13]。用数码相机拍照保存。

1.4.3 DGGE数据分析:DGGE指纹图谱用Bio-Rad公司的Quantity One 4.1.1分析软件进行分析。细菌群落丰富度、多样性、优势度和均匀度分别由马格利夫指数(Margalef’s richness)、香农-威纳指数(Shannon-Wiener index)、辛普森指数(Simpson’s diversity index)和皮卢指数(Pielou’s evenness index)表示。

1.5 统计分析

实验数据的方差分析采用SPSS 17.0,主成分分析(Principal component analysis,PCA)采用CANOCO for Windows 4.5软件进行,多元回归树分析(Multivariate regression tree,MRT)采R语言中mvpart程序包的mvpart函数。

2 结果与分析 2.1 土壤理化性质分析

各样点菌塘土壤和对照土壤的理化性质测定结果见表 1。从整体上看,所有样品间的理化性质存在一定的差异。但各个县域之间松茸菌塘土壤理化性质存在差异,同县域之间松茸菌塘土壤理化性质虽存在一定差异,但很多并未达到显著水平,同时菌塘土壤与对照土壤的理化性质也存在相同情况。参照土壤肥力分组标准,所有松茸菌塘土壤及对照土壤的肥力水平处于中上水平,而对照土壤肥力则总体低于菌塘土壤。由此可初步看出,在四川松茸产区更肥沃的土壤更适于松茸的生长。

表 1 不同样点土壤理化性质(n=3) Table 1 Soil physicochemical properties of different soil samples(n=3)
样品 Sample pH 有机质 OM (g/kg) 全氮 TN (g/kg) 速效氮 AN (mg/kg) 速效磷 AP (mg/kg) 速效钾 AK (mg/kg) 有效铁 Fe (mg/kg) 有效锰 Mn (mg/kg) 有效铜 Cu (mg/kg) 有效锌 Zn (mg/kg) 交换性钙 Ca (cmol/kg) 交换性镁 Mg (cmol/kg)
XJ1 6.41ab 168.9b 5.07ab 277.0ab 13.4cd 186.7bc 42.85bc 26.39bc 0.59d 1.84bc 36.08ab 1.14ab
XJ2 6.90a 124.6b 6.72ab 280.7a 9.0cd 386.0a 38.40cd 27.91bc 0.86cd 2.28bc 37.58ab 1.36a
XJ3 6.26ab 91.6b 1.73b 206.0ab 6.1cd 277.3ab 40.42bc 23.82bc 0.78d 1.66bc 27.43bc 0.93ab
XJ4 6.11ab 329.0a 2.65b 214.0ab 5.2cd 287.0ab 43.01bc 26.57bc 0.70d 1.58bc 31.40b 0.81b
XJ5 6.41ab 272.4ab 4.95ab 158.0b 9.0cd 221.7bc 39.90cd 21.81bc 0.98cd 1.61bc 44.54a 1.33a
XJCK 6.85ab 94.3b 3.87b 241.0ab 7.7cd 77.7c 39.18cd 19.49c 0.59d 0.74c 27.68bc 0.85ab
YJ1 4.98b 208.1ab 6.46ab 154.0b 23.8bc 280.3ab 55.50ab 25.01bc 0.59d 4.67a 13.60cd 0.66bc
YJ2 5.72ab 200.6b 4.58ab 154.0b 20.2bc 267.7ab 63.85a 20.89c 0.34d 1.49bc 12.25cd 0.59bc
YJ3 5.54b 228.5ab 6.26ab 206.0ab 31.0b 300.7ab 48.91bc 27.95bc 0.62d 3.34ab 23.31bc 0.52bc
YJ4 5.04b 257.1ab 5.13ab 128.3bc 19.8bc 257.0b 49.53bc 27.78bc 0.38d 2.77b 14.00cd 0.43bc
YJ5 4.84b 151.2b 3.17b 128.7bc 14.1cd 241.0bc 50.52bc 23.67bc 0.30d 2.14bc 11.50cd 0.49bc
YJCK 5.71ab 138.5b 4.65ab 148.3bc 12.0cd 278.7ab 33.31cd 29.27ab 0.31d 0.66c 16.04cd 0.49bc
YB1 5.06b 218.9ab 4.38ab 199.3ab 13.9cd 239.3bc 41.33bc 29.25ab 3.86a 3.28ab 11.71cd 0.37bc
YB2 5.48b 159.5b 3.63b 225.3ab 6.1cd 178.3bc 41.49bc 25.28bc 3.36ab 2.25bc 10.71d 0.28c
YB3 5.36b 177.2b 4.71ab 137.0bc 7.6cd 262.3b 45.05bc 30.00ab 2.57b 2.71b 14.52cd 0.38bc
YB4 5.16b 194.4b 4.07b 189.0b 5.2cd 246.7b 43.36bc 28.31b 2.40bc 2.77b 9.72d 0.28c
YB5 5.17b 226.1ab 7.13a 222.7ab 13.4cd 296.7ab 51.04b 22.91bc 3.69ab 3.91ab 24.77bc 0.63bc
YBCK 5.12b 96.5b 1.79b 183.3b 1.5d 104.7c 29.20d 9.86d 1.68c 0.28c 12.93cd 0.29bc
ML1 5.15b 209.6ab 5.54ab 185.0b 9.8cd 277.7ab 49.19bc 31.69ab 0.46d 4.26ab 20.21cd 0.94ab
ML2 5.73ab 234.2ab 5.54ab 186.7b 43.5ab 349.0ab 49.61bc 31.47ab 0.69d 3.82ab 15.82cd 1.14ab
ML3 4.98b 187.0b 4.54ab 182.7b 14.6c 267.0ab 38.75cd 28.98ab 1.12cd 1.34bc 21.14c 1.12ab
ML4 5.34b 136.6b 2.98b 157.7b 38.4ab 342.0ab 47.33bc 30.73ab 0.69d 2.05bc 16.29cd 0.59bc
ML5 5.15b 240.0ab 5.20ab 213.7ab 45.2a 289.7ab 45.96bc 29.50ab 0.74d 3.85ab 17.94cd 0.89ab
MLCK 4.92b 134.6b 2.26b 239.7ab 6.1cd 198.3bc 20.06d 27.47bc 0.37d 0.51c 17.84cd 0.67bc
YY1 5.63b 151.3b 2.55b 121.3bc 11.4cd 230.0bc 56.79ab 35.91a 1.24cd 2.78b 8.13d 0.43bc
YY2 5.09b 243.0ab 6.58ab 163.3b 7.4cd 281.0ab 47.88bc 31.35ab 1.03cd 3.83ab 14.17cd 0.65bc
YY3 5.94ab 174.4b 4.05b 120.0bc 11.5cd 277.0ab 49.27bc 31.10ab 0.80d 2.87b 14.34cd 0.53bc
YY4 5.95ab 219.7ab 4.98ab 140.0bc 5.7cd 277.0ab 44.97bc 30.50ab 1.36cd 2.61bc 11.26d 0.62bc
YY5 5.15b 197.2b 5.90ab 168.0b 11.1cd 286.3ab 45.02bc 30.25ab 0.78d 2.84c 11.28d 0.53bc
YYCK 5.56b 167.6b 1.79b 62.0c 1.1d 120.3c 30.78cd 17.66c 0.74d 0.46c 4.42d 0.41bc
注:表中数值为3次重复的算术平均值,在同一列中不同字母表示差异显著(P<0.05).
Note: The arithmetic mean of three replicates is shown with its arithmetic standard deviation. Different letters in the same column indicate significant differences (P<0.05).
2.2 基于土壤理化的主成分分析

松茸菌塘土壤及对照土壤PCA结果如图 1所示。其中,第1个主成分的方差贡献率为52.6%,第2主成分的方差贡献率为26.3%,前两个主成分的累积方差贡献率为78.9%,在一定程度上能代表土壤肥力系统的变异信息。由表 2可知,主成分1主要与土壤有效锌、速效钾、总氮、有效铁、速效磷、有机质、有效锰有关,说明它主要反映了土壤发生的自然因素影响;主成分2则主要与交换性钙和交换性镁有关,说明它主要反映了土壤母质类型的影响;主成分3主要与土壤有效铜、速效氮、速效磷有关,说明主要反映了矿化分解因素的影响。因此,主成分1可命名为土壤发生自然因素,主成分2可命名为土壤母质类型,主成分3可命名为土壤矿化分解作用。

图 1 基于土壤理化的主成分分析图 Figure 1 The PCA plot of soil physical and chemical properties
表 2 各测定项目的主成分得分 Table 2 Component score of the tested indexes
指标 Index 成分 Component
1 2 3
pH −0.048 0.259 −0.069
有机质 OM 0.161 −0.011 0.085
总氮 TN 0.198 0.071 0.218
速效氮 AN 0.005 0.233 0.354
速效磷 AP 0.169 0.005 −0.248
速效钾 AK 0.211 0.048 −0.092
有效铁 Fe 0.184 −0.075 −0.103
有效锰 Mn 0.177 −0.032 −0.079
有效铜 Cu −0.003 −0.103 0.644
有效锌 Zn 0.228 −0.067 0.176
交换性钙 Ca 0.011 0.318 0.089
交换性镁 Mg 0.063 0.298 −0.112

所有样品大致可分为5个相对独立的群。其中,绝大多数样品聚集在同一群内(群Ⅰ),而XJ2与YYCK单独成群(群Ⅱ和群Ⅴ)。究其原因,样品XJ2和样品YYCK主要理化性质较为特殊。样品XJ2总体肥力最高,其中pH (6.9)、速效氮(280.7 mg/kg)、速效钾(386.0 mg/kg)及交换性镁(1.36 cmol/kg)指标最高;而样品YYCK总体肥力水平较低,其中,速效磷(1.1 mg/kg)、有效铁(30.78 mg/kg)及交换性钙(4.42 cmol/kg)指标为所有样品中最低。木里对照土壤(MLCK)与3个松茸菌塘土壤样品聚为群Ⅲ,而小金对照土壤(XJCK)及盐边对照土壤(YBCK)聚为群Ⅳ。可以发现,除了盐源对照土壤(YYCK)与大部分样品距离较近外,其余所有对照样品均与大部分松茸菌塘样品距离较远,显示了对照土壤的理化特性与菌塘土壤发生了一定程度的分化。

2.3 菌塘土壤细菌群落结构多样性

根据DGGE图谱的条带数量、迁移率及灰度(图 2),分别计算了样品的细菌多样性指数(表 3)。不同县域之间多样性指数有着明显差异,木里和盐边菌塘土壤细菌多样性较高,而小金则较低。同一地区内,对照土壤细菌多样性指数也并不一定完全低于或高于菌塘土壤。例如,小金对照土壤XJCK的马格利夫指数、香农-威纳指数、皮卢指数及辛普森指数高于另3个小金松茸菌塘土壤样品;而雅江对照土壤YJCK的香农-威纳指数显著低于雅江松茸土壤(p<0.05)。

表 3 不同土壤细菌群落多样性指数(n=3) Table 3 The bacterial diversity index of different soil samples (n=3)
样点编号 Sampling No. 马格利夫指数 Margalef index 香农-威纳指数 Shannon-Wiener index 皮卢指数 Pielou’s evenness index 辛普森指数 Simpson’s diversity index
XJ1 3.71c 3.42c 0.997ab 0.967c
XJ2 3.33c 3.33c 0.998ab 0.964c
XJ3 3.53c 3.40c 0.999ab 0.966c
XJ4 3.78c 3.48c 0.999ab 0.969bc
XJ5 4.26bc 3.61bc 0.999ab 0.973bc
XJCK 4.23bc 3.59bc 0.999ab 0.972bc
YJ1 3.69c 3.48bc 0.999a 0.969bc
YJ2 3.23cd 3.32c 0.995b 0.963c
YJ3 3.44c 3.38c 0.993b 0.966c
YJ4 3.09cd 3.29c 0.999ab 0.963c
YJ5 3.12cd 3.29c 0.999a 0.962c
YJCK 2.31d 2.97d 0.998ab 0.948c
ML1 3.38c 3.37c 0.999ab 0.965c
ML2 5.05b 3.82ab 0.999a 0.978a
ML3 5.14a 3.83ab 0.999a 0.978ab
ML4 4.96b 3.77ab 0.999ab 0.976a
ML5 4.35bc 3.65bc 0.999a 0.974bc
MLCK 4.66bc 3.72bc 0.999a 0.975a
YY1 4.11bc 3.59bc 0.997ab 0.972bc
YY2 5.04b 3.79ab 0.996ab 0.977a
YY3 5.12a 3.81ab 0.995b 0.977a
YY4 4.73bc 3.73b 0.996ab 0.976a
YY5 4.68bc 3.72bc 0.996ab 0.976a
YYCK 4.65bc 3.71bc 0.996ab 0.975b
YB1 4.85b 3.77ab 0.998ab 0.977a
YB2 4.73bc 3.70bc 0.997ab 0.974bc
YB3 5.93a 3.99ab 0.998ab 0.981ab
YB4 6.01a 4.00a 0.997ab 0.981a
YB5 5.83a 3.97ab 0.997ab 0.981ab
YBCK 5.08a 3.81ab 0.996ab 0.977a
注:表中数值为3次重复的算术平均值,在同一列中不同字母表示差异显著(P<0.05).
Note: The arithmetic mean of three replicates is shown with its arithmetic standard deviation. Different letters in the same column indicate significant differences (P<0.05).
图 2 土壤细菌DGGE指纹图谱 Figure 2 DGGE profile of bacterial communities of the soil
2.4 土壤因子对菌塘细菌多样性影响

土壤理化因子对松茸菌塘细菌多样性的影响如多元回归树(图 3),该树整体能解释总离差平方和的92.1%,树的复杂性参数值(Complexity parameter,CP)为0.01,其交叉验证误差和交叉验证标准误分别为1.210和0.299,能较好地反映土壤理化因子与菌塘土壤细菌多样性之间的相关关系。在所有选择的12个土壤因子中,有效铜、有机质、pH、速效氮、交换性钙及速效钾6个因子参与了多元回归树的构建。

图 3 菌塘细菌多样性与土壤因子的多元回归树分析 Figure 3 Multivariate regression tree of diversity of shiro associated with soil factors 注:Cu:有效铜;OM:有机质;AN:速效氮;Ca:交换性钙;AK:速效钾;Error:相对误差;CV error:交叉验证误差;SE:交叉验证标准误.
Note: Cu: Available copper; OM: Organic matter; AN: Available nitrogen; Ca: Exchangeable calcium; AK: Available potassium; Error: relative error; CV error: cross-validation error; SE: cross-validation standard error.

多元回归树第一次分割以有效铜0.651 7 mg/kg为节点,将所有30个样方分为两组,该次的分解能解释总离差平方和的43.8%。在有效铜<0.651 7 mg/kg的10个样品中,有机质是影响其多样性的主要因素,其次是速效氮,节点分别为136.5 g/kg及151.2 mg/kg。该组结果显示,当有效铜≥0.296 7 mg/kg且<0.651 7 mg/kg时,有机质(136.5g/kg≤OM≤257.1 g/kg)含量越大、速效氮(151.2 mg/kg≤AN≤277.0 mg/kg)越大细菌多样性越高。在有效铜≥0.651 7 mg/kg的20个样品中,pH、有效铜、交换性钙及速效钾是影响土壤细菌多样性的主要因素。在一定范围内,pH (4.800<pH<6.028)越小、有效铜(0.651 7 mg/kg≤Cu<2.040 0 mg/kg)含量越小、交换性钙(9.697 cmol/kg≤Ca<23.300 cmol/kg)含量越大,速效钾(243.0 mg/kg≤AK<296.7 mg/kg)含量越大,松茸菌塘土壤细菌多样性越大。

在此次多元回归树的构建过程中,共有6个所选环境因子没有出现在回归树中,分别为总氮、速效磷、速效铁、速效锰、有效锌及交换性镁,该6个土壤理化因子对松茸菌塘细菌多样性的影响并不是特别大。

3 讨论

土壤是松茸及其寄主植物的生长载体,同时也为松茸的生长提供必要的营养元素。松茸生长地土壤的质量对松茸的发生起着较为关键的作用。廖树云等[14]研究发现松茸菌丝主要分布在寄主根比较集中的真土层中,土壤含水量低、通透性好、偏酸性、有机质、全氮、有效氮及微量元素含量较丰富的土壤有利于松茸的发生。傅伟杰等[15]通过对松茸发生地土壤的理化性质进行分析研究认为,土壤因子与气候、地形、生物等因子共同存在对松茸起着综合性的影响,理化适宜的土壤是松茸生长发育良好的基地。孟珍贵等[16]研究表明,松茸菌塘土与非菌塘土理化性质差异明显,松茸的生长吸收大量的营养成分而导致菌塘土肥力较弱。而本研究发现松茸菌塘土壤理化性质之间存在一定差异,菌塘土的总体肥力水平高于非菌塘土壤,但并未达到显著水平。这在一定程度上表明,肥沃的土壤可能更适宜于四川松茸的生长。

珍稀食药用菌生长的森林环境变化和人类活动都会影响菌塘土壤中的细菌多样性和群落结构。随着子实体的生长、发育,菌塘土壤理化性质必然引起变化,进而其细菌多样性及群落组成也会有所不同。清源等[17]研究发现土壤容重、粉粒含量、pH值、全氮含量、交换性钙镁含量是中国西南地区印度块菌生长的主要限制因子。同时笔者前期研究也发现,生态环境因子中一些因子能显著影响松茸菌塘土壤微生物活性和生物量[18]。本研究所选择的12个土壤理化因子中,有效铜、有机质、pH、速效氮、交换性钙及速效钾6个因子对菌塘土壤细菌多样性影响较大,而总氮、速效磷、速效铁、速效锰、有效锌及交换性镁则影响较弱。多元回归树不仅修剪出了客观的模型,而且在一定程度上指示了关键技术参数。当然,不同地区由于气候、光照、种类等相差巨大,关键的土壤因子也往往有所不同。

目前,对于松茸菌塘微生物的研究仍然较少,细菌多样性及群落结构与松茸生长发育之间的关系也仍然是个待解之谜。但有一点可以肯定的是,松茸的生长是严格受制于菌塘微生物和土壤肥力的。如果能够研究清楚松茸菌塘微生物群落结构、土壤理化性质以及它们与松茸生长之间的关系,对于松茸的病害防治、品质外观改善,甚至是松茸的人工抚育、人工栽培都有着重大意义。本文研究为了解松茸菌塘理化特性及影响细菌多样性的土壤因子提供了一个可行的思路,但离揭示其中的“秘密”仍然差距甚远。因此,在未来的研究中应选择一种更为科学和全面的方法,深入探究菌塘细菌、放线菌、真菌甚至是古菌的多样性及群落结构,结合土壤理化性质,分析两者之间相互关系和动态变化,进而联系松茸的生长发育,寻找到影响松茸人工栽培的关键因子。

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