ε-聚赖氨酸(ε-Poly-L-lysine，ε-PL)作为一种天然防腐剂，已知的ε-PL产生菌基本仅在链霉菌科(Streptomycetaceae)和麦角菌真菌(Ergot fungi)中发现^{[1, 2]}。目前ε-PL产生菌筛选方法仍为传统的化学方法，存在工作量大、周期长等劣势，所用染料存在一定毒性。

ε-PL的合成及聚合度控制是由ε-PL合成酶，Pls是一种非核糖体肽合成酶(NRPS)，其结构域的排布特征已在模式菌株S. albulus NBRC 14147中得到了比较系统的研究。随着细菌已测序基因组数目的急剧增长，基于基因组序列挖掘ε-PL产生菌可作为一种新的选择。本期介绍了王静、谭之磊、欧竑宇等发表的论文“细菌基因组序列中ε-聚赖氨酸合成酶的生物信息学识别与分析”^[3]，作者开发了一种基于Pls的结构域特征和作用机制生物信息学识别算法，应用该算法在已测序的细菌基因组中进行了Pls识别，发现编码Pls的菌株主要属于放线菌，但并不局限于已知的链霉菌科中；所预测的Pls均具有相同的结构域排布，而跨膜结构域和Linker区相对不保守，仅在少数位点存在保守的氨基酸残基或有特定残基分布特征，其中一些位点已被报道与ε-PL聚合度相关。

虽然作者提出的预测方法的准确性还有待于验证，但与单纯的序列比对相比，该方法为ε-PL产生菌的筛选提供新的思路；另外用该方法发现的保守氨基酸残基可为ε-PL产生菌的改造提供思路。