中国科学院微生物研究所、中国微生物学会主办
文章信息
- 牛坤, 梅子龙, 管安奇, 蔡文斌, 陈懋钦, 柳志强, 郑裕国
- NIU Kun, MEI Zilong, GUAN Anqi, CAI Wenbin, CHEN Maoqin, LIU Zhiqiang, ZHENG Yuguo
- 重组大肠杆菌合成L-甲硫氨酸的发酵过程优化
- Optimization of the fermentative production of L-methionine by engineered Escherichia coli
- 生物工程学报, 2024, 40(3): 895-907
- Chinese Journal of Biotechnology, 2024, 40(3): 895-907
- 10.13345/j.cjb.230388
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文章历史
- Received: May 23, 2023
- Accepted: August 7, 2023
L-甲硫氨酸(L-methionine, L-Met),又名L-蛋氨酸,是人和动物自身不能合成的8种必需氨基酸中唯一的含硫氨基酸。它参与细胞内的转甲基作用,是蛋白质生物合成的最基本单位,还是许多小分子物质如谷胱甘肽、S-腺苷蛋氨酸和肾上腺素等合成的前体物质,具有重要的生理功能[1-3]。全球L-甲硫氨酸需求量近十几年以来一直保持着6%左右的年增长率,预计未来几年仍将保持这一水平[4],市售90%以上的L-甲硫氨酸应用于饲料添加剂行业,因此,L-甲硫氨酸的稳定供应是全球禽肉消费市场持续增长的坚实保障。工业上生产L-甲硫氨酸主要采用丙烯醛合成DL-蛋氨酸的化学法生产工艺[5-7],其合成工艺路线长,在其生产过程中不可避免地会使用剧毒、恶臭的氢化物和硫化物,技术与设备要求高、投入资金巨大、混旋甲硫氨酸分离难度大,而且还存在对环境和人类自身健康安全等方面的诸多弊端,从而导致该行业技术壁垒高、行业集中度高,寡头垄断市场严重。因此,近年来国内外学者将目光转向生物发酵法合成L-甲硫氨酸的研究,并取得了初步进展,而由于L-甲硫氨酸化学结构的特殊性及其代谢调控的复杂性,与已实现工业化发酵生产的氨基酸相比,L-甲硫氨酸的发酵产量仍未达到工业化要求[8-9]。
L-甲硫氨酸、L-赖氨酸、L-苏氨酸和L-异亮氨酸同属于天冬氨酸家族氨基酸,该族氨基酸的合成在不同微生物中基本相似[10-13],除了L-甲硫氨酸外其余几种氨基酸均已实现发酵法工业化生产。微生物细胞中L-甲硫氨酸合成途径受到严格的调控,从自然环境中分离到能够在胞外积累L-甲硫氨酸的野生菌株产量都很低,同时传统的微生物育种方法在L-甲硫氨酸选育方面进展缓慢,而随着对甲硫氨酸合成机制的深入了解,采用理性设计的策略,通过代谢工程的手段去改造微生物生产L-甲硫氨酸逐渐受到各国学者的青睐[14-16]。L-甲硫氨酸的生物合成涉及一个典型的多模块生物合成途径,可以分为碳骨架合成模块、一碳单位供给模块以及硫源供给模块,几个模块之间相互关联、相互制约,影响L-甲硫氨酸的生物合成[17]。
由于生物体内复杂的生物合成机制,使得L-甲硫氨酸的生产受到限制,为了提高L-甲硫氨酸的发酵产量,研究学者开展了包括代谢途径的重建、反馈抑制的解除、关键酶的修饰和发酵工艺的优化等方面的研究。Li等从大肠杆菌(Escherichia coli) 3110出发,首先敲除了L-甲硫氨酸合成阻遏蛋白基因metJ以及竞争途径L-赖氨酸、L-苏氨酸相关基因,然后通过用metK84p取代天然启动子来减弱metK基因表达从而减少L-甲硫氨酸生成S-腺苷甲硫氨酸,最后通过过表达L-甲硫氨酸合成关键基因得到最优菌株,其L-甲硫氨酸产量在15 L发酵罐中补料分批发酵48 h后达到5.62 g/L[18]。本课题组对L-甲硫氨酸合成细胞工厂的构建开展了大量研究工作,Huang等通过对L-甲硫氨酸的代谢途径进行模块化分析,系统地探究各关键节点,揭示了3个模块的关键控制节点以及代谢过程中面临的代谢阻力,通过改造,菌体L-甲硫氨酸产量在5 L发酵罐中补料分批发酵48 h后达到16.86 g/L[19];Niu等用FBA对重组E. coli W3110BL分批发酵L-甲硫氨酸的代谢通量进行分析,估算了不同溶氧条件下的细胞内通量分布,发现在30%溶氧水平下生产L-甲硫氨酸的通量高于其他溶氧水平[20];进一步以E. coli W3110 ΔIJAHFEBC/PAM为底盘菌,首先通过在基因组上原位互补lysA基因来修复L-赖氨酸合成途径,然后用动态调节的启动子PfliA替换原位启动子,以构建非营养缺陷型菌株。此外,进一步修饰中心代谢途径和L-半胱氨酸分解代谢途径,最后,在5 L生物反应器中,在不添加外源氨基酸的情况下,L-甲硫氨酸发酵产量达到17.74 g/L[21]。
随着合成生物学的发展,L-甲硫氨酸的微生物细胞工厂不断被优化,合成路径中相关抑制途径被改造,摇瓶产量逐渐提升,但通过发酵工艺优化调控其代谢过程鲜有报道。因此本研究在实验室前期构建的L-甲硫氨酸高产菌株E. coli W3110ΔIJAHFEBC trc-fliY trc-malY/PAM glyA-22 metF的基础上[22],开展L-甲硫氨酸发酵工艺优化的研究,期望通过不同发酵工艺的比较寻找限制L-甲硫氨酸合成的关键影响因素,提高L-甲硫氨酸的发酵产量,为L-甲硫氨酸的全发酵法工业生产奠定良好的数据基础。
1 材料与方法 1.1 材料 1.1.1 菌种本研究所用菌株基因型为Escherichia. coli W3110 ΔmetI ΔmetJ ΔlysA ΔglyA Trc-metH Trc-metF Trc-cysE Trc-serB Trc-serC Trc-fliY Trc-GCV Trc-malY metAFbr+ yjeH+ serAFbr+ metF+ glyA+ (命名为M4),由本实验室构建并保藏[22]。
1.1.2 培养基LB培养基(g/L):胰蛋白胨10,NaCl 10,酵母提取物5。
LB固体培养基:LB培养基中加入2% (质量体积分数)的琼脂。
发酵培养基(g/L):葡萄糖10,CaCl2·2H2O 0.08,MgSO4·7H2O 5,柠檬酸2.50,KH2PO4 2.50,K2HPO4·3H2O 1.38,FeCl3·6H2O 0.12,(NH4)2SO4 3.30,Na2S2O3 3.95,VB12 0.01,VB1 0.01,L-赖氨酸0.05,盐溶液SSA 2 mL/L,盐溶液SSB 1 mL/L。
补料培养基(g/L):葡萄糖500,MgSO4·7H2O 5,FeCl3·6H2O 0.06,(NH4)2SO4 33,Na2S2O3 39.50,甜菜碱0.50,盐溶液SSA 1.6 mL/L,盐溶液SSB 0.8 mL/L,VB12 0.01,VB1 0.01,L-赖氨酸0.05,溶剂为水。
盐溶液SSA组成为(g/L):ZnSO4·7H2O 8.50,MnCl2·2H2O 7.50,CuCl2·2H2O 0.75,CoCl2·6H2O 1.25,EDTA 4,溶剂为水。
盐溶液SSB组成为(g/L):H3BO3 3.0,Na2MoO4·2H2O 2.5,溶剂为水。
以上培养基的灭菌条件为115 ℃、30 min,其中补料培养基葡萄糖、Na2S2O3单独灭菌。VB12、VB1和L-赖氨酸采用0.22 μm无菌滤膜过滤除菌后加入培养基中。
1.2 方法 1.2.1 种子液培养用接种环从重组大肠杆菌M4甘油管中蘸取少量菌液,在具有Kan抗性的LB平板上进行划线,并放置于37 ℃的恒温培养箱中培养12−16 h;后用接种环挑取平板上饱满的单菌落,接种于具有Kan抗性的10 mL LB培养基中过夜培养;吸取1 mL菌液分别接种于3瓶装有100 mL含有Kan抗性的LB培养基的摇瓶中,在37 ℃、200 r/min的恒温摇床中培养10−16 h,作为种子液。
1.2.2 5 L发酵罐分批补料发酵种子液以15%的接种量接种于装有1.5 L初始发酵培养基的5 L机械搅拌发酵罐中,设定培养温度为30 ℃,初始转速为300 r/min,pH值为6.78,通气量为2 vvm,用50% (体积分数)氨水溶液调节pH值,溶氧通过关联转速(300−800 r/min)维持在30%左右。当发酵罐中的初始葡萄糖耗尽时,通过5 L机械搅拌发酵罐所配置的蠕动泵流加补料培养基来进行补料,当采用pH-Stat补料方式时,设置pH > 6.82时,自动通过蠕动泵进行补料;当采用DO-Stat补料方式时,设置DO > 30%时,自动通过蠕动泵进行补料;当采用恒速补料方式时,设置恒定的流速,自动通过蠕动泵进行补料。每隔4 h取样测定生物量、残糖及L-甲硫氨酸浓度[23]。
1.2.3 菌体生物量的测定菌体生长采用OD600表示,取1 mL发酵液,用超纯水稀释一定倍数后,用紫外-可见分光光度计于600 nm处测定其吸光值,测量值乘以稀释倍数即为菌株的光密度。根据OD600值和细胞生物量关系获得细胞生物量:细胞生物量(g/L)= 0.418 6×OD600−0.193 5。
1.2.4 残糖浓度的测定采用3, 5-二硝基水杨酸法绘制葡萄糖标准曲线。取发酵液1 mL,12 000 r/min离心10 min,取发酵上清液并稀释一定倍数,使其落入标准曲线范围之内。取500 μL稀释后的发酵上清液,加入500 μL DNS试剂,混匀后在沸水浴中反应5 min,后用冷水迅速冷却至室温,后加入4 mL蒸馏水,摇匀后于540 nm处测定吸光度,并通过葡萄糖标准曲线计算葡萄糖浓度。
1.2.5 L-甲硫氨酸浓度的测定取1 mL发酵液在12 000 r/min条件下离心10 min,后取上清并稀释至适当倍数后进行衍生化反应。衍生化反应为100 µL样品稀释液+300 µL CNBF (0.27 g CNBF/10 mL乙腈)+500 µL硼酸钠缓冲液(0.2 mol/L硼酸+0.05 mol/L硼砂,pH为9.0),60 ℃、600 r/min避光反应1 h。使用赛默飞世尔科技公司超高压液相色谱(ultra-high pressure liquid chromatography, UPLC)仪检测,色谱柱为C18柱(4.6 mm×250 mm, 5 µm),设置参数为检测波长260 nm,进样量10 µL,柱温30 ℃,流速0.8 mL/min。液相色谱洗脱程序采用梯度洗脱,流动相A:纯乙腈;流动相B:缓冲液(蒸馏水: 乙腈: 三乙胺=848:150:2,乙酸调节pH为4.9)[24]。
1.2.6 副产物氨基酸和有机酸浓度的测定发酵液副产物氨基酸采用赛卡姆(北京)科学仪器有限公司全自动氨基酸分析仪进行检测。有机酸采用赛默飞世尔科技公司超高压液相色谱仪检测,色谱柱为Aminex® HPX-87H (300 mm×7.8 mm, 0.25 µm),设置参数为检测波长200 nm,进样量20 µL,柱温60 ℃,流速0.6 mL/min。液相色谱洗脱程序采用恒速洗脱,流动相:8 mmol/L H2SO4溶液,保留时间:20 min。
1.2.7 细胞生长动力学模型及其参数估计微生物细胞生长动力学可由很多模型来进行描述,其中Monod方程及Logistic方程最为简单和常用。Monod方程主要用来描述非抑制性单一底物限制情形下的细胞生长,事实上,在发酵过程中,菌体浓度的增加对自身生长也会产生抑制作用,此时细胞的生长可以用Logistic方程较好地进行描述[25-26]。选择在最优的补料策略下,用Logistic方程描述菌株M4的生长规律,其微分方程为:
(1) |
式中:μm为M4的最大比生长速率,h–1;dX/dt为M4的生长速率,g/(L·h);X为M4的生物量,g/L;t为M4的发酵时间,h;Xm为M4的最大生物量,g/L。
1.2.8 L-甲硫氨酸合成动力学模型及其参数估计采用Luedeking-Piret方程[26]描述产物生成随时间变化过程,其微分方程为:
(2) |
式中:dP/dt为L-甲硫氨酸合成的速度,g/(L·h);P为L-甲硫氨酸的产量,g/L;α为生长偶联系数;β为非生偶联系数。其中,α≠0、β=0表示产物生成与细胞生长相关(生长相关型);α≠0、β≠0表示产物生成与细胞生长部分相关(生长部分相关型);α=0、β≠0表示产物生成与细胞生长无关(非生长相关型)。结合公式(1)和公式(2),对Luedeking-Piret方程进行积分处理,得到相应的代数方程,见式(3)。
(3) |
式中:P0为L-甲硫氨酸初始产量,g/L。由于L-甲硫氨酸初始含量为0,因此P0可忽略不计。
2 结果与分析 2.1 不同初糖浓度对发酵合成L-甲硫氨酸的影响碳源是微生物生长最重要的营养物质,但其浓度的高低会极大影响到菌体的生长代谢,当浓度过低时不能满足微生物生长的需要,使微生物生长缓慢甚至死亡裂解,也可能在菌体生长未达到最佳状态时就被迫停止生长;而当糖浓度过高时会产生底物抑制,从而阻遏菌体生长,同时过高的糖浓度会增加副产物的积累,典型的有乙酸副产物的积累会劣化发酵环境,从而影响菌体生长,另外,高糖浓度会升高发酵液的渗透压,进而影响微生物菌体的正常生长[27]。因此,本文首先在5 L发酵罐中考察了不同初始葡萄糖浓度对于发酵合成L-甲硫氨酸的影响,采用DO-Stat方式进行补料,发酵过程菌体生长、残糖浓度及L-甲硫氨酸的合成情况如图 1所示。
从图中结果可以看到,初始糖浓度对菌体生长趋势影响较小,发酵前60 h菌体生长过程相似,而在15 g/L和20 g/L初糖条件下,菌体对数生长期相对较长,整体发酵周期比低初糖浓度延长了20−30 h,这对工业发酵是不利的。就L-甲硫氨酸的合成过程而言,5 g/L和10 g/L初糖浓度下的L-甲硫氨酸的合成情况明显好于高初糖浓度,最高发酵产量为24.26 g/L (10 g/L初糖),此时糖酸转化率为9.33%。综合菌体生长和产物合成过程,选择10 g/L的葡萄糖浓度为M4菌株分批补料发酵的初始糖浓度。
2.2 不同补料方式对发酵合成L-甲硫氨酸的影响 2.2.1 pH-Stat和DO-Stat补料对发酵合成L-甲硫氨酸的影响pH-Stat和DO-Stat补料方式分别依据发酵过程中pH和溶氧(dissolved oxygen, DO)的变化进行补料发酵,调控过程较为简单,是常用的补料策略。因此本文进一步采用上述两种策略进行补料发酵,发酵结果如图 2所示。由图中结果可知,L-甲硫氨酸的发酵过程为生长偶联型,其发酵产量随菌体量的升高而不断提高,在发酵12 h,初糖基本耗完,此时分别开启pH-Stat补料流加葡萄糖使pH稳定在6.8左右以及DO-Stat补料流加葡萄糖使溶氧稳定在30%左右。在pH反馈补料策略下,发酵罐中的残余葡萄糖浓度始终维持在接近零值的水平,避免了因葡萄糖浓度过高对菌体生长产生的抑制作用,这也使得菌体量达到较高水平,OD600在72 h达到了56,但该水平下的葡萄糖可能仅能满足微生物基础代谢,而对合成产物不利,在发酵84 h,L-甲硫氨酸产量达到最高值20.19 g/L。
与pH-Stat策略相比,DO反馈补料策略下,可以满足菌体对溶氧的需求,菌体生长也较好,发酵74 h后OD600达到最大值48。同时,DO-Stat补料策略可以使残余葡萄糖浓度维持在2−5 g/L的范围内,从而有利于L-甲硫氨酸的合成,最终L-甲硫氨酸产量在84 h达到了24.26 g/L,比pH-Stat补料策略提高了20.16%,糖酸转化率提高至9.33%。
2.2.2 恒定残余葡萄糖浓度补料发酵对合成L-甲硫氨酸的影响综上两种反馈补料策略可知,pH-Stat和DO-Stat反馈补料方式在发酵后期均会导致培养基中残糖浓度升高,这主要是由于该阶段菌体生长基本稳定,耗糖量降低,葡萄糖的不断流加仅用于合成产物从而导致了一定残糖的积累,而葡萄糖浓度控制在适当的水平不仅可以满足菌体生长对碳源的需求,还可以避免代谢“溢流”的发生,提高目的产物的产量,因此,残糖的调控对L-甲硫氨酸的发酵过程较为重要。本文后续进一步考察了不同恒定残糖浓度对L-甲硫氨酸发酵合成的影响,在发酵前期使菌体自然生长,不进行补料,当初始葡萄糖基本消耗完毕后(12 h左右),开始流加补料培养基;并每4 h进行取样,测定发酵液中的残糖含量,并及时改变补料流加速度,使葡萄糖浓度维持在一定范围内。根据前期对M4菌种耗糖情况及生长环境的了解,将残糖浓度分别控制在1−5 g/L和5−10 g/L范围内,这两种恒定残余葡萄糖浓度补料方式的发酵过程如图 3所示。
从发酵过程曲线可以看出,维持恒定残糖浓度在1−5 g/L和5−10 g/L的补料方式下,L-甲硫氨酸最终的发酵产量相差不大,但过程变化相差较大。第一种补料方式表明在整个发酵过程中,L-甲硫氨酸的产量均在缓慢增加,在发酵90 h达到最大值22.26 g/L;第二种补料方式下,L-甲硫氨酸在发酵前48 h快速合成,48 h后合成速率显著降低。两种补料方式下,菌体生长情况也有较大差距,恒定残糖浓度为1−5 g/L补料方式的最大OD600仅为43.6,而5−10 g/L补料方式的最大OD600却达到了57.9;这可能是因为1−5 g/L残糖浓度下还是会出现类似于反馈补料的葡萄糖“半饥饿”现象;在菌体的指数生长期,菌体快速生长,对葡萄糖的需求较高,而在此阶段残糖浓度控制较为困难,导致出现葡萄糖“半饥饿”现象。同理,在菌体的衰亡期,补料培养基的流加速度也应该及时减缓,过量的葡萄糖会影响L-甲硫氨酸的合成,增加副产物有机酸的生成。而恒定5−10 g/L的残糖浓度使菌体可以较好地生长,前期L-甲硫氨酸合成速率也较高,但发酵48 h后随着菌体生长进入稳定期,L-甲硫氨酸的合成速率逐渐降低,最终产量为21.32 g/L,这进一步说明了在L-甲硫氨酸发酵过程中工艺调控的重要性。
2.2.3 恒速补料对发酵产L-甲硫氨酸的影响恒速补料是所有补料方式中最为简单的一种,在工业化发酵过程中也较易操作。它能在一定程度上满足菌体对营养物质的需求,但恒速补料也有明显的弊端,因为在不同的发酵阶段,菌体量、生长速率以及发酵环境的优劣会使菌体对于营养物质的需求不同,而恒速补料不能及时适应这种变化来及时作出调整,因此这对于菌体的生长代谢是极为不利的。根据反馈补料方式中M4菌株的耗糖速率,设置了2.5 g/(L·h)和5 g/(L·h)的恒定速度进行补料,发酵过程如图 4所示。
从图中结果可以看出,以5 g/(L·h)的恒定速度进行补料时,L-甲硫氨酸产量以及最大菌体量都高于2.5 g/(L·h)恒速补料的情况,但相对上述几种补料方式而言,L-甲硫氨酸的产量均显著降低。对残糖数据进行分析可以发现,在以5 g/(L·h)速度恒速补料时,在发酵20−60 h,残糖浓度逐步升高,最高达到了14 g/L左右,显然,在前期菌体生长较慢的阶段,5 g/(L·h)的补料速度导致残糖浓度超出了此时菌体对葡萄糖的需求浓度,对菌体的生长和代谢造成了一定的影响,在发酵60 h以后,随着菌体量的增多,葡萄糖的消耗也增加,残糖浓度逐步下降,菌体继续生长,此时L-甲硫氨酸的积累量也显著增加,从60 h的8.50 g/L提升至92 h的17.35 g/L。而在2.5 g/(L·h)恒速补料方式下,前期的残糖浓度维持在一个较低且稳定的水平,说明2.5 g/(L·h)的补料速度跟菌体前期的耗糖速度相近,但在发酵60 h时,葡萄糖的流加量明显不能满足菌体生长代谢的需求,此后的残糖浓度基本都在1 g/L以下,而营养物质的缺失也必将对菌体的生长代谢造成负面影响,最终L-甲硫氨酸仅为15.94 g/L,这也是在2.5 g/(L·h)恒速补料方式下后期的菌体量以及产量都较低的原因。因此,上述结果可以看出恒速补料的方式并不适用于L-甲硫氨酸的发酵补料过程。
2.3 联合调控策略下的分批补料发酵基于上述实验的开展,对M4菌株5 L罐中发酵代谢的情况有了较为全面的了解,发现葡萄糖的调控是较为关键的因素,因此在pH、溶氧等参数条件稳定的情况下,如何调控好发酵环境中的葡萄糖浓度是至关重要的一环。基于此本研究开发了适用于M4菌株发酵合成L-甲硫氨酸的3种联合补料策略。在发酵前12−24 h,菌体处于指数生长期,葡萄糖的消耗量较大,糖浓度变化幅度较大,此阶段的葡萄糖调控最为困难,人为地改变补料速度很容易造成葡萄糖的添加量过多或者不足,因此选择在此阶段采用溶氧反馈的补料策略,溶氧反馈可以提供较为稳定的发酵环境,能让关键的发酵前期菌体较好地生长。在发酵24 h之后,菌体生长趋于稳定,但菌体量的不断升高也会使耗糖量逐步提升,因此在该阶段选择变速补料策略,变速补料可以在菌体浓度较高的情况下加入更多营养物来促进细胞的生长,实现细胞比生长速率不断增加,有利于产物的形成。再基于前期实验对M4各阶段耗糖量的了解,分别设置了如表 1所示3种不同联合补料策略,其发酵进程如图 5所示。
Feeding strategy | 12−24 h | 24−48 h | 48−72 h | 72 h−end |
A | DO-Stat | 10 mL/h | 20 mL/h | 30 mL/h |
B | DO-Stat | 20 mL/h | 30 mL/h | 40 mL/h |
C | DO-Stat | 15 mL/h | 20 mL/h | 25 mL/h |
从图 5结果可以看出,3种联合补料策略都取得了较好的效果,L-甲硫氨酸产量相比上述补料方式均有提升,分别达到29.09、30.11 g/L和31.71 g/L。相比之下,联合补料策略C更优于前2种,虽然在该策略调控下细胞生物量低于前2种调控方式,但其发酵产量最高,达到31.71 g/L。同时,3种联合补料策略下达到最高产量的时间分别为84、80、68 h,采用联合补料策略C使发酵周期明显缩短,这在工业放大中是十分重要的。分析整个发酵过程可以发现,C策略中变速补料的流加速度更适宜M4菌种的生长代谢,从发酵过程图中的残糖数据可以看到,A策略下,发酵中期葡萄糖流加速度偏低,造成营养物质的缺失,影响了菌体的生长,B策略下,发酵中后期葡萄糖的流加速度过高,流加葡萄糖浓度明显高于菌体的葡萄糖消耗量,这会对菌体的生长代谢造成负面影响,使得后期产物的合成速率下降,以致造成发酵周期较长,但产量并没有显著提高。
进一步比较了不同补料策略下的发酵结果,由表 2可知,在联合补料策略C下,单位菌体的生产能力达到1.74 g/g菌体,糖酸转化率升高至12.2%,较其他补料策略有显著提高。综上,本实验获得了较优的补料发酵策略,即在发酵0−12 h,不流加补料培养基;在发酵12 h初糖基本消耗完毕后,开始流加补料培养基;发酵12−24 h,采用溶氧反馈流加补料培养基;发酵24−48 h,以15 mL/h的恒定流速流加补料培养基;发酵48−72 h,以20 mL/h的恒定流速流加补料培养基;发酵72 h至发酵结束,以25 mL/h的恒定流速流加补料培养基。发酵结束L-甲硫氨酸在68 h的产量最高,为31.71 g/L,糖酸转化率为12.2%,相比于M4未优化前的产量18.20 g/L[22]提高了74.2%,是目前全发酵法合成L-甲硫氨酸所报道的最高产量。
Feeding strategy | Time (h) | L-Met titer (g/L) | Cell growth (g/L) | Productivity (g/g cell) | Glucose conversion rate (%) |
pH-Stat | 84 | 20.19 | 20.52 | 0.98 | 7.77 |
DO-Stat | 74 | 24.26 | 19.90 | 1.22 | 9.33 |
1−5 g/L residual glucose | 92 | 22.26 | 17.76 | 1.25 | 8.56 |
5−10 g/L residual glucose | 92 | 21.33 | 24.04 | 0.89 | 8.20 |
Feeding at 2.5 g/(L·h) | 76 | 15.94 | 15.96 | 1.00 | 7.97 |
Feeding at 5 g/(L·h) | 92 | 17.35 | 20.40 | 0.85 | 6.67 |
Combinatory feeding strategy A | 84 | 29.09 | 20.61 | 1.41 | 11.19 |
Combinatory feeding strategy B | 80 | 30.11 | 23.29 | 1.29 | 11.58 |
Combinatory feeding strategy C | 68 | 31.71 | 18.18 | 1.74 | 12.20 |
基于上述不同补料方式的研究,选择了DO-Stat补料、恒定1−5 g/L残余糖浓度补料和最佳联合补料策略C等3种具有代表性补料方式进行发酵副产物的测定与比较分析,以更好地了解M4菌株在不同补料方式下的生长代谢情况,并为后续的代谢工程改造实验提供思路。
主要副产物氨基酸的合成情况如图 6A所示,3种补料方式下谷氨酸的积累量都较高,其中恒糖补料的谷氨酸积累量达到9.7 g/L,这说明在三羧酸(tricarboxylic acid, TCA)循环中有大量的碳流从α-酮戊二酸走向了生成谷氨酸的路径;同时还有少量的苏氨酸和异亮氨酸积累,异亮氨酸是苏氨酸的代谢产物,而苏氨酸作为L-甲硫氨酸生物合成的竞争代谢途径,其存在势必会对L-甲硫氨酸的产量造成影响,因此后续代谢改造过程中苏氨酸合成途径的调控是改造的重点方向。除此之外,联合补料策略C调控下还生成了一定量的亮氨酸和苯丙氨酸,这说明在丙酮酸节点处,一部分碳流合成了这2种氨基酸,反映出该调控方式下丙酮酸进入TCA循环的路径受到抑制;同时有机酸合成结果(图 6B)也表明在联合补料策略C下乙酸积累量提高,这进一步说明在该策略下进入TCA循环的碳流降低,因此后续在该调控方式下可以考察由丙酮酸进入TCA循环通路的改造,以提高下游L-甲硫氨酸的合成通量。α-酮戊二酸是TCA循环中一个重要的节点,3种补料条件下均表现出积累,表明TCA循环的代谢通量未能完全流向产物合成途径,这也可能是造成丙酮酸未能完全进入TCA循环的重要原因。乳酸是细菌在无氧条件下产生的,在联合补料策略C条件下,乳酸生成量降低,这对发酵是有利的。通过比较联合补料策略C与其他补料策略下副产物合成的差异,为进一步指明在该发酵条件下菌株改造的方向,为后续菌株的进一步代谢改造提供了更为有力的数据支撑。
2.5 细胞生长动力学方程及其参数采用Logistic方程对M4在联合补料策略C发酵数据进行非线性曲线拟合,拟合曲线如图 7所示,从相关性系数R2的结果可以看出,该模型对于M4生长的模拟也具有很好的适用性,M4的细胞生长动力学Logistic方程为:
采用Luedeking-Piret方程对M4在联合补料策略C发酵数据进行非线性曲线拟合,拟合曲线如图 8所示,L-甲硫氨酸合成动力学模型为:
其中α=0.79,β=0.02,说明蛋氨酸的合成与细胞生长部分相关。曲线中相关性系数R2为0.993,表明该模型适用于M4合成L-甲硫氨酸的发酵过程。
3 结论本文以实验室前期的代谢改造菌株M4为出发菌株,以葡萄糖作为切入点开展了L-甲硫氨酸5 L发酵罐的分批补料培养优化。在确定培养基初始糖浓度的条件下,依次比较了pH反馈补料、溶氧反馈补料、恒定残糖浓度补料和恒速补料策略的发酵情况,对M4菌株的生长、糖耗和L-甲硫氨酸合成情况进行了较为全面的了解,并在此基础上开发了适合M4发酵合成L-甲硫氨酸的新型联合补料策略。通过在发酵12−24 h,采用溶氧反馈流加补料培养基;在24−48 h,以15 mL/h的恒定流速流加补料培养基;在48−72 h,以20 mL/h的恒定流速流加补料培养基;在72 h至发酵结束,以25 mL/h的恒定流速流加补料培养基,使L-甲硫氨酸在68 h达到最高产量31.71 g/L,相比于未优化前的18.2 g/L提升了74.2%,是目前L-甲硫氨酸的微生物发酵法所报道的最高水平。同时,建立了细胞生长和L-甲硫氨酸发酵合成的动力学模型,模型可以较好地拟合发酵过程,为后续为L-甲硫氨酸的全发酵法工业生产提供了一定的借鉴和参考。
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