小克银汉霉核糖体DNA PCR扩增产物的限制性片段长度多型性 |
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中文关键词:小克银汉霉属,毛霉目,分类,PCR,限制性片段长度多型性 内转录间区 |
英文关键词: |
基金项目: |
黄河 毛伟敏 郑儒永 |
中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学开放研究实验室 北京 100080 |
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中文摘要: |
应用一对寡核苷酸引物ITSl与ITS4对核DNA G+C百分数小于30%的小克银汉霉(Cunninghamella)属的核糖体DNA(rDNA)内转录间区(ITS)进行了扩增。测试的属于10个种和变种的22株菌都得到了扩增产物。在同属不同种之间扩增的ITS片段长度有巨大差别。据此可分为三组。这三组所含分类群数及其DNA长度分别为:第一组4种1变种,小于 764碱基对(bp);第二组2种,765~824 bp;第三组2种l变种,大于825 bp。所研究的许多种中,特别是第三组,单凭其PCR产物的长度就能区分开来。但在第一、二组就需借助限制性内切酶的分析才能予以区分。我们选用了Rsa I,Tru 9 I,和Hinf I 4种限制性内切酶,对所有扩增产物进行了限制性片段长度多型性(RFLPs)的分析。在雅致小克银汉霉(C elegans),巴西玉蕊小克银汉霉(C.bertholletiae)、和布拉氏霉(C. blakesleeana )各种的限制性酶切图谱,种内非常一致而种与种之间有差别。反之,在某些种其限制性酶切图谱不仅种间互不相同,在种内不同株之间也出现1~3种酶切图型的差异。在这种情况下,只能综合各种资料才能将它们区分开来。本研究肯定了PCR-RFLP在区分小克银汉霉种和变种上的意义,并发现种内个体的差异。这在我们后来所进行的序列分析研究中得到了进一步的证实。 |
英文摘要: |
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黄河,毛伟敏,郑儒永. 小克银汉霉核糖体DNA PCR扩增产物的限制性片段长度多型性[J]. 菌物学报, 1999, 18(3): |
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